Stoffet kan give kontaktallergi. Astma-Allergi Danmark tillader kun Chlorhexidine digluconate i produkter hvor det vurderes at den desinficerende funktion af produktet ikke kan undværes. Chlorhexidine digluconate er ikke tilladt i produkter til generel brug.
Ingrediensen kan i større mængder være irriterende for øjnene. Vi stiller dog krav til at den samlede koncentration af irritanter skal være lav og der tages i vurderingen hensyn til anvendelsen af produktet og den mængde af ingrediensen brugeren kommer i kontakt med. Derfor kan der findes ingredienser der er øjenirriterende i produkter anbefalet af Asthma Allergy Nordic.